Особенности постановки на учет налогоплательщиков в качестве налогоплательщиков налога определяются Министерством финансов РФ (п. 3 ст. 335 НК РФ). Инструкции, посвященные порядку постановки на учет в качестве плательщика налога на добычу полезных ископаемых, установлены Приказом МНС РФ от 31.12.2003 № БГ-3-09/731 «Об утверждении особенностей постановки на учет в налоговом органе организации или индивидуального предпринимателя в качестве налогоплательщика налога на добычу полезных ископаемых».